民国初年,草医文氏因治愈阎旅长之疾而上京并得以重用。进京后,以“以惊治惊,怪招迭出”的方法治愈了众多百姓和达官贵人,从而创建三块堂,得名“文三块”。得到了百姓爱戴的同时,文三块也触动了同行的利益,并与于世勋、张宗瀚和焦二爷等结怨,遭到了多次陷害,最终倾家荡产。 几经周折,文三块治愈了焦夫人,焦二爷感恩,并与于世勋等反目。历经艰难,三块堂重新开张。 挣扎在功名与世俗泥潭中的文三块因一次失败的救治,领悟到自己的浮躁和功利,开始了人生的反省,与依旧钟情他的紫玉再续前缘。 北洋政府垮台,七七事变爆发,至抗战胜利,心中满目疮痍已六十载的文三块化解了晚辈的矛盾,携紫玉离开京城,再渡行医与人生的新旅程。。主角·山本大介在年幼时因飞机失事而流落南美的亚玛逊河流,但奇迹的是他能够靠自己一个人生活下去,更在森林中练就一身钢铁般的身躯。 但此时邪恶组织·基度想利用古代印加文明征服世界,为了对抗基度,古代印加文明的承继兼守护者巴哥长老对山本大介施手术,并于左臂殖入印加秘宝叽叽腕轮,将他改造而成的神秘战士蜥蜴改造人·假面骑士亚玛逊。大介之后回到日本欲查明自己身世,进而展开与入侵日本的十面鬼率领之基度组织对抗的命运。。