资深特工伊森·亨特也有百密一疏时刻,他在接收最新任务时遭到神秘组织“辛迪加”的暗算落入对方手中。辛迪加是一支由全球各地前特工组成的秘密组织,此前一直被CIA视为空穴来风。在对方成员伊莎·福斯特的帮助下,伊森逃出生天,并及时向威廉•布莱德汇报了辛迪加确切存在的消息。然而此时布莱德的日子并不好过,他负责的IMF机构因俄罗斯核弹头等事件遭到CIA指控并责令解散。在得知该组织密谋刺杀奥地利总统时,伊森联系上了老搭档班吉·邓恩展开行动,并于谜样女郎伊莎再度相会。
接下来的一连串事件中,辛迪加的真面目逐渐揭开,而他们也终于显露出真实的目的……。制造核武器的重要原料浓缩铀从朝鲜半岛的那个国家流出,这一事件引起邻国日本、韩国乃至美国的高度关注。为防止可能发生的核恐怖袭击,CIA、公安、NIS派出大量特工,一场看不见硝烟的间谍战在和平年代下悄悄展开。公安外事4课负责人住本健司(渡部笃郎饰)受命寻找失踪的原日籍科学家徐昌义(田中泯饰),与此同时,日籍韩裔商人奥田正秀(申贤俊饰)拥有重大嫌疑,成为外事警察重点盯防的对象。为了找到奥田从事恐怖活动的证据,住本命令部下松泽阳菜(尾野真千子饰)接近奥田的妻子果织(真木阳子饰)。内心承受巨大煎熬的果织该如何面对这个自己并不了解的丈夫,而她的心中又藏着怎样的秘密。最后时刻一点点迫近…… 本片根据麻生几创作的同名间谍小说第二部改编。。