日本室町时代中叶,当权的幕府威信锐减。野心勃勃的醍醐景光(中井贵一饰),为了成就霸业,而将尚未出生的儿子百鬼丸献祭给48个魔神,他和妖怪定下约定,取走了包括眼、耳、口、鼻等在内的48个器官。
一出生就缺少器官部位的百鬼丸,被抛入河中,后来为医生养父(原田芳雄饰)所救,替他制作了义眼、义肢等补足了身上缺失,并命名为百鬼丸(妻夫木聪饰),抚养他长大。为了摆脱自己被诅咒的命运,夺回身体的每一个部分,百鬼丸向占有自己器官的48个魔神宣战,离家踏上征战之旅。
在寻找魔神的旅途上,百鬼丸遇到了自称“侠盗”的多罗罗(柴崎幸饰),为了得到百鬼丸手中的宝剑,多罗罗跟随他一起踏上旅程。。德瓦家和邻村是世仇,但是德瓦家的当家却一直致力于消弭两家的仇恨,甚至将不听劝阻参与两家械斗的儿子吉赶出了家门。吉痛定思痛,决定追随父亲的意思以德报怨,用爱去感化仇家,因此他通过接近仇家的儿子和女儿成功混进了邻村。吉的命运如何,他是否能消除两家延续数代的仇恨,化干戈为玉帛呢?。