小行星撞击地球,主要大地受到名为「忍」(シノビ)的毒害,形成异形攻击人类,人们只能逃向以前是海底的「海陆」;拯救的方法唯有复活「机神将」(机神将(ギガロード))。约五百年后,亡国「伊势」的公主巫女雨、与拥有人间兵器「柳生」(ヤギュウ)之血的少年周防二人挺身而出……。故事发生在遥远的2078年,矿业组织NEB在天狼星6B行星上发现了名为“Berynium”的元素,该元素蕴含着巨大的能量,可以用来充当能源使用。组织派遣了一批矿工前往行星进行能源开采,然而工人们很快就发现,Berynium拥有强烈的放射性,根本不适合使用。 虽然矿工们强烈要求停止任务,但组织却不为所动,无奈之下,矿工们自发的组成了“联盟”,和组织之间开始漫长的对抗。为了抵挡组织的猛烈攻击,联盟研制出了小型机器人“Screamer”,它拥有敏捷的身手和强大的攻击力,给敌方造成了巨大的伤害。然而,联盟并不知道的是,在不知不觉间,机器人们已经进化出了自我意识,想要成为这颗星球上的主宰者。。