齐州银行会计陈一平与刑警蒋寒可谓风马牛不相及的两个人,因为一起库款盗窃案将二人的命运联系在了一起。警方介入后,陈一平积极协助调查,不久薛非进入警方视线,眼看案件有点眉目,薛非却突然自杀身亡。而发现薛非秘密的陈一平如芒刺背,他决意辞职另谋饭碗。不料事与愿违,在递交辞职报告第二天,他收到一张神秘的软盘,里面的内容让陈一平感觉坐在了一颗随时爆炸的定时炸弹上。蒋寒对薛非的死因调查取得重大进展,他感觉薛非死亡背后定有惊天阴谋,事实证明了他判断的正确。陈一平已踏上一条不归路,在冬至那天深夜,惊魂未定的他在日记本中只写了2002年12月20日……。曾经,来自海洋的神秘敌人“塞壬”向人类发起了猛烈的进攻,“碧蓝航线”的少女们凭借着她们钢铁般的意志与敌人奋勇作战,最终击败了对手,守护了人类。然而,随着时间的流逝,碧蓝航线内部因为理念的差异逐渐产生分化,衍生出了名为“赤色中轴”大的对立阵营。 被称为“灰色的幽灵”的最强英雄企业(石川由依配音)、每天都迷迷糊糊但关键时刻意外的顶用的拉菲(长绳麻理亚配音)、虽然年纪不大但成熟体贴的大黄蜂(山本希望配音),个性好强但心地善良的哈曼(伊藤明日香配音),面对动荡的时局,当这些少女们再一次被推上战场,会发生怎样的故事呢?。