在上一季中,以果敢干练的作风和高超惊人的医术,人称 “Doctor X”外科医生大门未知子(米仓凉子 饰)在早已形同腐臭泥潭一般的帝都医科大学第三医院力挽狂澜,掀起前所未有的风暴。因在北海道马场冒险为一匹骨折的马做手术,未知子得到内科专家马渊一代(三田佳子 饰)的赏识,进而受邀踏入全日本顶尖医者云集的殿堂——帝都医科大学附属医院!此前不久,外科总负责人蛭间重盛(西田敏行 饰)曾亲手为医院的大金主——某地产大鳄二宫钦也(寺田农 饰)完成高危手术,谁知此番二宫癌症复发再度入院。第二外科主任海老名(远藤宪一 饰)携团队积极备战,配合蛭间迎接新一轮的手术。而马渊所率领的内科则就治疗方式上与外科产生严重分歧和对立。
未知子的到来,无疑使双方的矛盾趋于白热化……。被一个机器人带领的恐怖分子占领了核弹中心,并打算将一枚导弹发射到华盛顿。当权者很希望能够协商处理,而恐怖分子则透露了他们的真正目的。而在核弹中心工作的一个女人、她的孩子和一个修理工决心阻止恐怖分子的计划在火星环绕的通讯卫星站“卫星五号”突遭一艘庞大的外太空采矿船“西伯利亚号”拦腰冲撞,直接迫使“卫星五号”脱离轨道坠向火星。卫星站上的工作人员为了自救,不得不派遣一组人员进入西伯利亚号内部调查,他们惊觉该船引擎已被设定成自动冲向火星表面。就在他们进行解除引擎设定过程中,西伯利亚号上的一具变形生化人突遭启动,开始残杀出现在他面前的每一个人…。